注射HPV疫苗是否仍會感染尖銳濕疣，需根據疫苗種類，以及注射疫苗前是否已有感染進行判斷。HPV疫苗包括2價、4價、以及9價疫苗。4價和9價疫苗包含HPV低危型，也就是包含導致尖銳濕疣的型別，但2價疫苗不包含，注射2價疫苗，雖然不保護尖銳濕疣，但防癌效果較好。4價和9價疫苗也可以防癌，同時也可以防性病，尖銳濕疣。此外，目前有的HPV疫苗是預防性的疫苗，不是治療性，如果已經感染HPV，可以預防沒有感染過的HPV型別，減少感染。但已經感染低危型病毒，疫苗并沒有用。