每個患者對疼痛的感覺不同，有些患者感覺藥流很疼，有些患者感覺藥流不疼。疼痛主要是由于子宮收縮導致，疼痛時間每個患者也不同，短則2-3個小時，長則7-8個小時都有可能，甚至有些患者＞8小時仍未排胎時，則需要進行人工流產。藥流通常需要服藥3天，前2天需要服用米非司酮，作用是競爭孕激素的受體使胚胎凋亡，在服藥的第3天需要服用米索前列醇。米索前列醇可以作用于子宮的平滑肌使子宮收縮，將已經凋亡的胚胎排出體外后完成藥流的全過程，部分患者排胎無需刮宮，而少量患者有排胎不全或不能排胎時，需要進行清宮手術使胚胎排出。