藥物流產早期終止妊娠方式與人工流產一樣，肯定會出現腹痛。腹痛的現象，只要是終止妊娠都會出現，即使無痛人流后期只要麻醉藥效果失效以后，都會疼痛。 多數人在用完米索前列醇后1個小時左右開始出現腹痛，宮縮痛同時作用是使胎囊排出來，另外是宮頸擴張。所以宮頸擴張過程中腹痛比較厲害，尤其胎囊在往出排的瞬間，疼痛較嚴重，而且這種疼痛會逐漸加重，特別是胎囊與子宮壁剝離的過程中胎囊被擠壓。 排出的2-3個小時疼痛比較厲害，有的人甚至表現出痙攣性疼痛，無法忍受。這時給予杜冷丁進行緩解治療，杜冷丁還能擴張宮頸，排出胎囊的速度增快，可能會持續20小時左右的腹痛，以后會減輕。只要胎囊排出以后，大多數人腹痛明顯減輕。 由于藥物流產宮腔內會有創面，修復過程中會有緩慢鈍性的盆腔痛、宮縮痛，大約伴隨將近半個月。