一般查腦血栓，首選檢查顱腦CT或磁共振，這兩種檢查各有優勢。顱腦CT方便快捷，入院后隨到隨做，但發生腦梗塞通常24小時顯影。顱腦磁共振對早期的腦血栓比較敏感，能及時發現腦梗塞的發生。臨床上首選CT檢查的原因是CT對腦出血的敏感性高，如果患者考慮為腦血管病，進行CT檢查排除出血后，肯定就是腦血栓形成，可以制定治療方案。 下一步需檢查腦血栓的危險因素。第一是物理檢查，如觀察患者血壓情況，檢查有無血管聽診區的雜音；第二是化驗檢查，包括血脂、血糖、同型半胱氨酸、血栓相關指標；第三是血管超聲，如頸動脈彩超、經顱多普勒，檢查有無腦動脈狹窄和腦血流速度的改變等。