弱視患者可以進行飛秒手術，但飛秒主要是針對近視進行。弱視說明近視矯正視力不達標，做屈光手術僅可處理近視度數，但弱視依舊存在。因此，弱視的患者可以進行飛秒手術，但做完后達不到正常范圍視力。飛秒手術僅通過角膜激光掃描改變角膜曲率，從而矯正度數。但弱視可能存在視細胞功能低下或神經功能低下，矯正手術后視力無法達到正常范圍。 因此，飛秒手術可以處理近視，但由于視覺功能不足，近視的飛秒激光術后弱視患者的視力無法達到正常范圍，僅可達到未做飛秒激光近視手術前戴眼鏡的最佳矯正視力。因為弱視最佳矯正視力往往低下，如以前的視力僅為0.2、0.3，激光手術做完后視力仍然只有0.2、0.3。一般如果要做飛秒激光手術時，手術醫生都會明確告知患者手術后可能無法達到正常視力。