甲狀腺功能減退的原因比較多，有些是不可逆的原因，有些是可逆的原因，如甲狀腺炎、亞急性甲狀腺炎所導致的甲狀腺功能減退，隨著炎癥控制，甲狀腺細胞功能可以逐漸恢復，甲狀腺功能減退也可以完全恢復。但是大多數甲狀腺功能減退是不可逆性原因所導致，如橋本氏甲狀腺炎導致的甲狀腺細胞的破壞，131碘治療或者手術治療導致甲狀腺細胞的破壞，這種甲狀腺功能減退往往需要長期的終身的甲狀腺激素替代，盡管甲狀腺激素替代以后甲狀腺功能可以維持正常，但是激素替代一旦停止以后，甲狀腺激素又會出現不足的表現。 因為這種治療方式并不是針對病因的治療，而只是給予激素進行補充的替代治療，因此對于大多數甲狀腺功能減退的患者，激素替代治療可以讓甲狀腺功能完全正常，生活狀態和正常人也是毫無二樣的，但是不能夠減少激素或者停止激素的用量，一旦停止激素的使用又會出現甲狀腺功能減退相關的癥狀。