慢性腎小球腎炎的預后，與發現慢性腎小球腎炎時的蛋白尿水平、血壓水平、腎功能狀態以及腎臟病理密切相關。如果慢性腎小球腎炎發現比較早，僅表現為血尿、少量蛋白尿，沒有腎性高血壓，血肌酐正常，經過積極治療一般預后較好。慢性腎小球腎炎出現大量蛋白尿，或者伴有腎性高血壓、腎功能損害比較輕時，腎臟病理表現為局灶增生腎小球硬化時，經過積極控制血壓、減少蛋白尿，可以延緩血肌酐進展。當慢性腎小球腎炎患者出現大量蛋白尿，或者血尿比較突出，甚至反復出現肉眼血尿、不易控制的高血壓或者出現腎功能中度損害時，腎臟病理除腎小球系膜細胞、系膜基質的增生外，有比較多的節段硬化或者球形硬化、缺血性硬化時，常提示向腎衰竭、尿毒癥的方向發展。