不典型孤獨癥的治療和典型孤獨癥治療相同，即進行社會交往能力、語言交流能力、運動協調性以及生活自理能力等各方面的綜合培養。從2013年5月開始，醫學上已經將典型孤獨癥、不典型孤獨癥和亞斯伯格綜合征統稱為孤獨癥譜系障礙。因此患者診斷以后，要對每個孩子進行全面評估，根據孩子各方面的能力發展水平來制定適合孩子的培訓計劃，在家庭中或者同時到專業培訓機構進行培訓。 治療核心一定要建立良好的親子關系，因為孤獨癥兒童最大的困難在于人際交往。因此在家中父母和家人要以充分耐心包容孩子，創造機會引導孩子主動找家長玩。父母要表現出開心和喜悅，讓孩子感受到人際交往的美好，使得孩子越來越喜歡找爸爸媽媽玩，這樣就有機會教會孩子和人互動和交流。臨床觀察發現，從小和父母家里人關系越親密、越融洽的孤獨癥孩子，以后的康復效果越好。從小如果經常被逼迫、被勉強、不被理解和不被包容的孤獨癥孩子，更容易出現情緒和心理行為問題，難以適應社會。希望每個孤獨癥兒童都能擁有包容和溫和友愛的父母或其他家人，陪伴孩子適應社會，過上獨立自主、幸福喜樂的人生。