已經感染HPV16仍然可以打HPV疫苗，因為HPV疫苗除能夠預防HPV16感染外，還能夠預防HPV18感染，是二價疫苗，而四價疫苗也同樣。疫苗還有交叉保護作用，尤其是二價疫苗，因為佐劑特別好，除預防HPV16和HPV18，對與HPV16、HPV18類似的HPV型別，比如HPV31、HPV33也有一定的預防作用，所以這時打疫苗仍然有用，可以預防HPV16、HPV18。如果感染HPV16，只能預防HPV18，以及與HPV16、HPV18類似的型別。四價和二價疫苗都以預防HPV16和HPV18為主，九價疫苗還可以預防其他幾種高危型，但是HPV16和HPV18導致7成左右的宮頸癌發生。總體而言，感染HPV16后再打HPV疫苗仍然有效，但是對HPV16型別沒有用，因為疫苗是預防型疫苗，不是治療型疫苗，只對沒有感染過的HPV型別有用，對已經感染的HPV型別沒有作用。