睡覺醒來頭痛常見于以下原因：1、原發性頭痛：比如偏頭痛、緊張性頭痛、叢集性頭痛；2、繼發性頭痛：可以繼發于顱內外器質性的疾病，比如全身的系統性疾病，包括發燒、高血壓病、代謝中毒性疾病、腦病等。顱內外的器質性疾病也可能會導致繼發性頭痛，比如腦部腫瘤、腦炎、腦膜炎、頭部外傷、蛛網膜下腔出血、硬膜下血腫、腦出血、靜脈竇血栓形成等，均可能會導致頭疼。通常原發性頭痛患者可能病史較長，間斷出現，能夠自發緩解。繼發性頭痛病史較短，出現后與既往的頭痛性質不同，而且持續不能緩解，此時需到醫院就診。