紅斑狼瘡是一個多臟器多器官受累的疾病，每位患者的受累臟器和器官的側重點并不一樣，所以每一個臨床表現都要和相關各個系統、器官的疾病來進行鑒別，具體如下：1、細菌性或結核性胸腔積液：如果患者表現為胸腔積液時，就要和細菌性或結核性胸腔積液進行鑒別；2、細菌性肺炎：如果患者表現為狼瘡性肺炎，此時要和細菌性肺炎進行鑒別；3、腎臟疾病：如果患者是腎臟受累，要和原發性腎小球腎炎或原發性腎病綜合征進行鑒別；4、皮膚疾病：如果患者是皮膚受累時，要和慢性濕疹、蕁麻疹、紫癜這些疾病進行鑒別；5、免疫性疾病和系統性血管炎：狼瘡本身還可出現多種的自身抗體，以及不典型的臨床表現，例如患者出現關節腫、脹、疼痛、晨僵這些臨床癥狀時，要和類風濕關節炎進行鑒別。如果患者同時出現肺部、腎臟受累的情況，就要和系統性血管炎這些疾病進行鑒別；6、藥物性狼瘡：此外在臨床上應用的一些藥物，也可導致類似紅斑狼瘡的表現，即藥物性狼瘡，此時也要和系統性紅斑狼瘡進行相關鑒別。