小兒嗜血細胞綜合征是較危重的疾病，部分小兒可以治愈。小兒嗜血細胞綜合征在臨床上又分為兩類，一類為原發性嗜血細胞綜合征，大多是由于遺傳因素導致基因變異而出現嗜血細胞綜合征。另外一類為繼發性嗜血細胞綜合征，大多繼發于病毒感染、免疫系統疾病及腫瘤。對于遺傳性或原發性嗜血細胞綜合征，通常需要經過造血干細胞移植，才能最終達到治愈和緩解的目的。繼發性嗜血細胞綜合征主要針對原發疾病，如果是病毒感染所引起，需要積極控制病毒感染。如果是由于免疫系統疾病所引起，則需要積極治療免疫系統疾病，通常可以取得較好的效果。另外嗜血細胞綜合征一半的小兒，可以得到治愈。