幽門螺桿菌呼氣試驗檢測需要空腹，因為幽門螺桿菌檢測呼氣試驗的原理，是先讓病人空腹，最好不刷牙，先吹一口氣，這口氣會標明，稱為底氣袋。之后吃一粒尿素，尿素含有碳13或碳14同位素的碳，進入胃竇以后，如果有幽門螺桿菌感染，則會產生尿素酶。尿素酶會將尿素分解，變成氨和二氧化碳，二氧化碳隨著血液循環進入肺，0.5小時以后再次呼氣，這一袋氣稱為樣氣袋。將底氣和樣氣放到儀器進行檢測，看看前后同位素碳的濃度，得出準確數值，如碳13正常值是0-4dpm，而碳14正常值是0-100dpm，這樣能夠衡量感染的嚴重程度。如果進食以后，會將胃竇附近的尿素酶粘液沖洗掉，檢測結果會偏低，甚至是假陰性。因此醫生會強調做幽門螺桿菌檢測時，呼氣試驗一定要空腹。如果是白天，通常要空腹6小時以上，也可以進行。