神經性頭痛的發病原因如下：1、顱內器質性病變：刺激顱神經產生神經性頭痛癥狀，建議行頭顱核磁共振檢查，明確病因，同時建議到神經外科進行會診、治療；2、腦部神經功能障礙：由于精神、心理因素引起，主要見于目前精神壓力大、緊張、焦慮、抑郁等精神狀態，使腦部神經處于緊張的功能異常狀態，出現神經性頭痛；3、頸部疾病：比如頸源性頭痛，主要由于頸椎病或頸椎小關節病變，頸肩部軟組織損害，刺激頸神經產生神經性頭痛；4、其他：由于過度疲勞、睡眠不足、煙、酒過度等導致神經性頭痛癥狀。