如果患者已經有HPV感染，理論上可以繼續接種。因為HPV感染只是1-2個亞型的感染，而HPV疫苗接種可以預防沒有感染的HPV亞型的再感染，比如女性已經感染了HPV16亞型，但是仍然可以接種HPV疫苗，預防HPV18，甚至預防其他HPV亞型的繼續感染，但是保護性大大削弱。女性接種HPV的最佳時機是在有性生活之前，此時沒有HPV感染，保護性最強。尤其是HPV九價疫苗，建議在16-26歲接種，如在女孩剛滿16歲，沒有性生活時接種，可以起到最好的保護作用。