無痛胃鏡麻藥清醒過程較快，約2-3分鐘即可清醒。清醒后對于胃鏡的檢查沒有特別印象，但是完全恢復正常大概需要24小時。無痛胃鏡檢查時應用麻藥代謝較快，通常做完胃鏡2-3分鐘可以完全清醒，所以在睡著狀態下完成胃鏡檢查。但無痛胃鏡檢查使用的麻藥，可能對精細控制能力產生影響。所以做完無痛胃鏡不建議立即駕車，注射麻藥后存在類似于飲酒反應，可能產生酒駕問題。