精子結晶最常見于精子不液化的男性，男性發生精液不液化時，會出現精液結晶改變。精子不液化通常由于慢性前列腺炎所致，由于慢性前列腺炎導致致病微生物，造成前列腺、尿道黏膜出現水腫、糜爛，還會出現前列腺腺體炎性腫大。前列腺腺體發炎時會導致前列腺分泌的蛋白水解酶和纖維蛋白酶減少，由于上述兩種酶類參與精子液化過程，當缺乏時會出現精液不液化癥狀，會出現精液呈顆粒狀或結晶狀改變。男性出現精液呈結晶狀改變時，需及時到泌尿外科或男科就醫。通過精液細菌培養、精液真菌培養，以及精液支原體、衣原體培養，通常能找到致病微生物。通過選擇有效的抗生素，如阿奇霉素分散片、克拉霉素分散片、鹽酸多西環素膠囊、鹽酸米諾環素膠囊等藥物序貫治療4周左右，多數男性精液不液化癥狀會明顯好轉。