核酸檢測時，一般不會交叉感染，具體原因如下：1、一次性用物：核酸檢測采樣用的咽拭子，如鼻咽拭子、口咽拭子等，是一次性使用，不用擔心采樣用品會造成污染；2、及時手衛生：操作采樣的工作人員，操作完會及時做手衛生、手消毒，不會傳播病毒；3、檢測環境：核酸檢測的環境，若是室外開放的空間，一般不會存在新型冠狀病毒交叉感染的風險。若新型冠狀病毒檢測的場所，是相對室內的空間，也會有新風系統，將空氣定期更新，保持通氣，把可能存在的病毒及時清除。