服用氯氮平片，通常不會引起黑便。黑便是指糞便顏色純黑，如果進食黑色食物，或為補血服用鐵劑，此時糞便可呈現純黑色，但不需要特殊處理，只需等待糞便顏色逐漸正常即可。上消化道出血時也會出現黑便，糞便除發黑外，還會呈現較亮的狀態，像柏油狀，此時需盡快就醫處理，可能會是出現較危險的消化道出血。在服用氯氮平片期間，也可能會出現糞便顏色發深的情況，是由于氯氮平片膽堿能作用于腸道后，會減慢腸道蠕動，使糞便在體內停留時間過長，導致其氧化而顏色加深。如果在服用氯氮平片期間出現便秘、糞便顏色加深的現象，擔心是消化道出血時，建議做糞檢看是否有糞便潛血現象。如果有潛血，說明可能出現腸道問題，如果沒有潛血，可能是單純便秘引起糞便顏色加深。對于氯氮平片引起的糞便顏色加深，可以服用具有通便效果的中成藥，還應多食用富含纖維的蔬菜，以及多運動以加快腸道蠕動，促進排便。