只要室管膜瘤有機會獲得手術全切除，就有機會治愈，但是能獲得全切除的室管膜瘤較少，約50%。不能全切除的室管膜瘤則較難治愈，其結果往往是復發，并且放療和化療的效果都較差。室管膜瘤在不同區域表現出的差異性大，有2/3-3/4的室管膜瘤發生在幕下的后顱窩區域，此區域的室管膜瘤分兩種，一種是中間型，即長在腦干背側四腦室里面，切除比率較高，一種是側方型，發生在四腦室旁邊側隱窩，多見于低齡兒童，有著特殊的基因突變，常累及腦干側方，并且和神經根粘連，全切的幾率低，復發和播散幾率較高。 中間型室管膜瘤大孩子偏多，手術切除希望大，治愈效果好。長在幕上的腦室旁室管膜瘤全切幾率比幕下高，患者預后比幕下好。但是其中有特殊的基因，如RELA基因突變類型，則容易復發。椎管內的室管膜瘤可以為良性腫瘤，無論發生在脊髓內還是發生在終絲，手術全切除都可以獲得治愈，但是室管膜瘤在兒童中相對少見。