霉菌性尿道炎，臨床最常用的藥是制霉菌素片、氟康唑、特比萘芬，效果比較好。還可以用一些中成藥，包括三金片、銀花泌炎靈，也有治療尿道炎的作用，可以減輕尿道的水腫，促進局部的血液循環。還可以通過多飲水，保持尿道外口、會陰部的干燥，清潔衛生，霉菌在會陰部不容易存留，不容易生長。如果通過這些治療的方法，效果不好，炎癥比較重，還可以靜脈點滴，如使用制霉菌素等藥物靜脈點滴。靜脈點滴副作用比較大，一般用于嚴重的霉菌性感染，大部分通過口服或者外用一些藥膏，癥狀會消失。最重要的還要增強自身的抵抗力，盡量少用廣譜的抗生素，用廣譜抗生素以后，可以抑制其他的細菌，霉菌生長會更快。