手足口病是由腸道病毒感染引起，腸道病毒包括一大組病毒，如EV71、柯薩奇、埃可病毒等都會感染人，都可以引起手足口病的表現。手足口病的傳染源主要是感染了腸道病毒的病人，此種病人在發病期時會有大量的病毒排出，通過呼吸道、消化道傳染給其他人，除此之外還有未發病的隱性感染者，也會排出腸道病毒感染其他人，還有的正常的人，會有長期的腸道病毒的攜帶，日常生活中就會排出病毒，都會造成其他人的感染，所以病人和腸道病毒的攜帶者是最主要的傳染源。