通常全飛秒手術后多數患者不會復發，但也存在少數屈光回退現象。近視手術是在眼球表面制作凹透鏡，而傷口愈合過程中如果出現上皮增生過多或基質內形成瘢痕，則可能導致凹透鏡凹度降低，從而出現新的近視度數，稱為近視復發或回退。此外，若患者本身近視度數不穩定，如術前為100度近視，激光消除1年后又有新的近視出現，表現為度數增長100度。無論全飛秒、半飛秒或是其他準分子激光，均可能存在屈光回退問題，但發生幾率較低，多數患者術后不會出現近視復發。但如果出現復發，患者可通過繼續配戴眼鏡進行矯正，也可通過二次手術矯正殘余或新增近視。