卡肺往往鑒于免疫抑制的患者，如進行器官移植，后期使用免疫抑制劑，或者本身有免疫缺陷的疾病，如艾滋病這類原發病的患者，容較易并發機會性的感染。一旦感染發生，最突出的表現是發熱，大多數患者都存在發熱，除發熱外，通常具有呼吸困難，即缺氧，發比較迅速。再者有咳嗽、咳痰、胸痛等相應感染的表現。影像學上主要是腹瀉，間質性肺炎的改變，即復發的間質性肺炎浸潤，需做特殊的熒光染色，取肺泡灌洗液或者痰液，可以確診。