扁桃體通常不是在左側或者右側，而位于咽腔兩側。扁桃體為呈卵圓形的淋巴上皮組織，為一對淋巴上皮組織，位于咽腔雙側扁桃體窩內。扁桃體窩的前緣即舌腭弓，后緣即咽腭弓，扁桃體外側由被膜環繞，內側裸露于咽腔內。扁桃體為重要的淋巴上皮器官，在人體起到重要的防御作用。扁桃體內側面的黏膜上皮，向扁桃體實質深陷，形成6-20個盲管，即扁桃體隱窩，所以扁桃體的表面看上去凹凸不平。扁桃體隱窩常積存上皮組織膿性分泌物、食物殘渣以及細菌和病毒的繁殖的場所。當機體免疫力下降的情況下，導致隱窩開口堵塞而繼發炎癥，容易形成病灶，引起扁桃體感染，甚至引起重要臟器的炎癥，為扁桃體較為嚴重的并發癥。