神經上皮肉囊腫是良性腫瘤。實際為先天性的發育殘留，主要是在胚胎時期形成的囊腫，基本上處于穩定狀態，一般危害較小。隨著小孩的生長發育，囊腫也在長大，但對周圍的腦組織一般不產生嚴重影響。除非在一些特殊部位，如橋腦小腦角，神經結構異常復雜，可能會對周圍的神經產生壓迫，患者出現面肌抽動癥、三叉神經痛、聽力障礙等。另外部分囊腫長在蝶鞍，會對垂體有干擾，可能會引起垂體功能低下，或視力的改變。多數情況，神經上皮肉囊腫可以通過手術摘除，其包皮比較完整，容易切除，及早手術切除之后，對人體幾乎沒有影響。