去除扁桃體結石，通常都是在耳鼻喉科，扁桃體的所有病變，一般都是在耳鼻喉科診治。扁桃體結石實際上是慢性扁桃體炎的表現，慢性扁桃體炎持續不愈，有可能就會形成結石，但實際上這種情況，結石還是相對少見，大多數情況，只是扁桃體隱窩內存留的分泌物，以及混合飯渣形成的一些黃白色顆粒樣物，有時候被排出、咳出，患者就會認為是結石。實際上，這個情況并不是真正的結石，真正的結石黏附比較緊，取出時比較困難，可以造成一些小的創面和滲血。這些顆粒樣物，一般會慢慢被排出，通過漱口等也可以清除掉，雖然不一定馬上清除。這個情況一般還是認為是慢性扁桃體炎的表現，多數和胃酸、胃液反流刺激有關系，也就是反流性咽喉炎相關的癥狀。胃酸、胃液反流刺激導致扁桃體出現慢性炎癥，隱窩口擴張，容易存有分泌物及飯渣，最終形成黃色的顆粒樣物。這個情況，需要用抑制胃酸的藥物治療，比如質子泵抑制劑，連續用6-8周，一般就可以緩解反流性咽喉炎的癥狀，緩解這種慢性咽喉炎的癥狀。有時候需要連續用6個月，才能達到一個持續穩定的緩解效果。