夜里肛門疼痛是腸癌的可能性較小。部分直腸癌的患者可能會出現肛門不適感、墜痛感，或者肛門疼痛，但是與夜晚出現的一過性肛門疼痛不同。在門診中，患者描述夜間肛門疼痛一般為一過性或者是偶然發生，并且發生時間并無規律性，一般與神經性的盆底神經痛有關。可表現為肛門痛、肛周痛，或者尾骨痛，或是一過性的直腸痛，但不一定是腸癌。 在臨床上，一般認為腸癌是大腸癌、結腸癌或直腸癌，而小腸癌癥或小腸腫瘤相對比較少見。而夜里肛門疼痛可能是直腸癌的表現，但結腸癌一般不會引起夜里肛門疼痛，直腸癌的疼痛，通常發展到中期或者后期才出現。這種疼痛以肛門部的墜痛為主，如直腸癌距離肛門很近，侵犯到肛門周圍的神經，可能會出現劇烈的疼痛，但疼痛會在白天或夜里持續性發生，并非單純在夜里發生。其次，直腸癌的疼痛，也可表現為腹痛，但這類腹痛是一種痙攣性的疼痛，是腸內容物通過受阻造成，與普通腹痛有所區別。