臨床上最常見的原發性肺炎是各種外界病原菌引起的呼吸道感染的肺炎。即常見說的細菌性肺炎或病毒性肺炎。首先要分清楚是病毒性或細菌性，如果是病毒性肺炎，通常要抗病毒治療。目前抗病毒肺炎治療藥物有奧司他韋、阿比多爾。如果是細菌性肺炎，需針對相應的病原菌，使用對應的抗生素治療。 臨床最常見的肺炎鏈球菌引起的肺炎，可以使用青霉素類、二代頭孢類、大環內酯類藥物，針對原發性肺炎進行治療。