嬰兒吸痰時，如果是在醫院，通常采用吸痰機。吸痰機帶有負壓，是用一根較細的吸痰管連接吸痰機，從口咽部或鼻腔插入大氣道，通過負壓吸引將相應部位分泌物吸出。吸痰時間通常不宜過長，可以進行多次吸引，但也不適合特別頻繁地操作。此方法吸痰時畢竟是異物進入體內，小孩會有一定不適感，可能會反抗，從而可能引起黏膜損傷，出現吸出血的情況。但通常黏膜的修復能力較強，能夠較快自愈。所以要根據病情判斷、綜合選擇，包括此類有創性的吸痰治療方式。進行機械吸痰時，吸痰前通常會進行霧化，將痰液稀釋。如有拍背機可以進行機械拍背，或進行手工拍背，盡量將痰液排出體外。