脊髓空洞癥臨床分為五個階段，早期、中期和晚期，中期又分為中前期、中后期和中晚期。具體分析方法綜合了空洞大小表現和病情等因素。一般早期診斷恢復目標較高，晚期患者病情較重，恢復緩慢而困難。 具體來講，早期爭取脊髓空洞消失或者無癥狀，達到臨床治愈，中前期目標爭取最大程度好轉或者改善后再向治療躍近，中后期目標先求穩定，再求改善。中晚期目標先使病情逐漸緩慢發展下來，再求穩定下來而進行好轉。病情晚期僅能做到維持和支持。脊髓空洞癥發病晚期，臨床致殘率非常高，重者可以出現呼吸功能障礙。