對于腹瀉用藥不能一概而論，不同病因引起的腹瀉需進行不同的治療，達到緩解效果。臨床要明確腹瀉原因，包括感染性、非感染性腹瀉，急性、慢性腹瀉，不同類型治療方法不同。急性腹瀉常見類型為感染性腹瀉，包括細菌感染和病毒感染。細菌性腹瀉需應用抗生素，病毒性腹瀉需進行抗病毒治療。非感染性腹瀉通常為腸道菌群紊亂引起，需補充益生菌。慢性腹瀉可能為腸道功能紊亂所致，也可能是炎癥性腸病、腸易激綜合征(IBS)所致。腸易激綜合征需用解痙、調節腸道菌群及精神源性藥物，炎癥性腸病需要做腸鏡明確病因。