偶爾半夜腹痛考慮可能由不潔食物引起，經常性半夜腹痛應考慮腹部臟器是否存在其他疾病，最常見為存在腸道疾病，如小腸、結腸病變。應及時去醫院就診，建議女性可到婦科門診檢查子宮、附件是否存在其他疾病。排除婦科疾病后，再到泌尿外科進行彩超檢查，觀察是否存在輸尿管結石、膀胱炎等。若均排除，還應到結直腸肛門外科就診，觀察腸道內結腸是否存在疾病，必要時可進行結腸鏡或腹部CT檢查。若是男性，可就診泌尿外科、胃腸外科或者結直腸肛門外科。一般也需要彩超檢查，是否存在泌尿系統結石或者其他疾病。此外，可能需要做腹部CT、腸鏡檢查，檢查腸道是否存在其他疾病。