兒童甲亢首選藥物治療，甲亢藥物分甲巰咪唑和丙硫氧嘧啶，但兒童基本用甲巰咪唑，臨床常用藥為賽治。但治療甲亢同時有副作用，最常見的是皮疹。因此，服藥治療后復診，醫師都會問是否出現皮疹。此外，還需關注是否有中性粒細胞抑制、肝功能影響等副作用。因此，甲亢患兒復診時除需關注甲狀腺功能控制情況，還需定期復查血常規、肝功能，也屬于監測藥物副作用的內容。 若出現副作用，如出現皮疹，可以盡量用抗過敏藥物緩解。若用藥后皮疹能消失，則可繼續服用治療甲亢的藥物。如服用抗甲狀腺藥物后中性粒細胞低，可給予升白細胞藥物，如果白細胞能恢復正常水平，則也可以繼續服用藥物治療。出現肝功能副作用，處理也大致類似。如果副作用在控制范圍之內，可以繼續服用藥物，如果副反應很重，可能需要手術治療，但手術并非兒童甲狀腺疾病的第一治療方案。