化療都有副作用，胃癌化療最常見的副作用是脫發、惡心、嘔吐，化療藥物刺激血管，對血管造成損傷、骨髓抑制。正是因為有骨髓抑制，化療病人才要反復抽血，反復監測血常規判斷患者骨髓抑制級別。 除以上反應之外，胃癌化療的副作用還有遠期的毒性，即致癌、致畸，對于年輕女性會影響生育功能。胃癌本身是消化道疾病，患者可能會有消化道反應，在化療之后可能消化道反應會更加劇烈，如惡心、嘔吐、呃逆、上腹部疼痛不適、消化不良、食欲不振。