HPV疫苗實際上是針對一些特殊的高危亞型HPV，以及低危亞型HPV而研制出來的疫苗。但是不同疫苗所針對的亞型種類不同，所以作用也會有些許差別。具體如下：1、二價HPV疫苗：主要針對的就是高危亞型HPV中，最為嚴重的HPV16和HPV18，這兩種高危亞型人乳頭瘤病毒。由于這兩種高危亞型人乳頭瘤病毒感染的宮頸癌，占比大約70%，所以如果注射二價HPV疫苗，能夠預防大約70%的宮頸癌發生；2、四價HPV疫苗：在二價HPV疫苗基礎之上，又有針對HPV16和HPV18這兩種高危亞型，加上HPV6和HPV11這兩種低危亞型的四價疫苗。四價HPV疫苗一方面能預防大約70%的宮頸癌發生，由于其對HPV6和HPV11也有一定的預防效果，所以還可以預防絕大多數尖銳濕疣的發生；3、九價HPV疫苗：在四價疫苗基礎之上，又加入更多高危亞型HPV，所以九價HPV疫苗可以預防大約90%的宮頸癌發生。所以由于HPV疫苗，所覆蓋的高危亞型和低危亞型種類不同。因此，能夠預防的宮頸癌，以及是否能夠預防尖銳濕疣，也會有一些細微差別。