患者應用消炎藥后出現腹瀉，可能是腸道菌群發生紊亂，或者腸道菌群失調導致腹瀉。消炎藥是抗生素的俗稱，主要作用是殺滅致病菌。患者腸道內有大量細菌，其中包括致病菌、條件致病菌，以及益生菌，患者應用抗生素時，通常是無差別殺滅，殺滅致病菌是用藥目的。致病菌受到殺滅、抑制時，其它細菌也會受到影響，這時可能益生菌受到數量上的影響以后，導致腸道菌群紊亂，直接影響腸道功能，如果影響腸道黏膜上皮細胞的功能，可能會導致上皮分泌增加、腸道動力紊亂，就會出現腹瀉等情況。益生菌被殺滅以后，條件致病菌會變成致病菌，使腸道黏膜產生炎癥，以及其它影響也會導致腹瀉。患者應用抗生素時要嚴格選擇適應證，控制使用量和使用時間，同時應由醫生處方，患者應避免自行決定應用抗生素。抗生素有各自的藥理作用，也有不良反應，因此，任何藥物的應用都要嚴格篩選適應證，避免帶來腹瀉等問題。