耳根后面疼痛的原因包括耳大神經痛、隱匿性乳突炎、三叉神經痛等，原因和治療具體如下：1、耳大神經痛：耳根后面疼痛如果病程比較短，疼痛是陣發性，類似于針扎樣的一下一下痛，不是一天到晚持續痛，常見是一種神經痛，如耳大神經痛。耳大神經痛的原因有時候不明確，多數和病毒感染可能有關系，往往癥狀不算嚴重，可以觀察，一般可以在幾天之內逐漸自行緩解和恢復，不需要特別處理。如果持續不好，可以適當地使用卡馬西平等藥物治療，一般也可以取得比較好的療效；2、隱匿性乳突炎：如果疼痛持續加重，需要進一步做耳部的相關檢查，如耳部的CT或者磁共振等，進一步排除一下有沒有隱匿性乳突炎。隱匿性乳突炎相對比較少，經常伴發于慢性中耳炎持續多年的狀態。如果有隱匿性中耳炎，耳部CT可以發現乳突部有高密度影，必要時考慮手術治療。但如果只是神經痛，通過適當的藥物治療一般都可以慢慢緩解，而不需要手術治療；3、三叉神經痛：如果是三叉神經痛，有時也需要通過手術來解除微血管的壓迫，才能得以根治。