跖疣使用藥物一般不作為主要的治療手段，因為跖疣是由人乳頭瘤病毒感染所導致。目前人乳頭瘤病毒簡稱HPV，沒有特效的治療方法，所以主要是以物理治療為主，并沒有特效藥。物理治療的方法主要是以液氮冷凍為主，當然也可以做二氧化碳激光，或者是其他的物理治療。做液氮冷凍以后，疣體和周圍的組織會出現水腫或者是水皰、血皰，結痂以后慢慢的這個痂就會脫落，將疣體帶下來。但是一次一般都掉不干凈，需要重復的治療。如果疣體數量很多，做起來非常的痛苦，治療周期也非常長。在物理治療的基礎上，還可以用干擾素注射、口服異維A酸膠丸來增加治療效果，縮短治療的周期。總之，跖疣的治療最主要的還是以物理治療為主，最常用的物理治療是液氮冷凍。如果皮損數量很多、周期很長，在物理治療的基礎上，可以加上肌肉注射干擾素、口服異維A酸膠丸，可以縮短療程，增加治療效果。