做腸鏡導致腸穿孔的可能性并不大，一般每年的發生幾率在1%左右，全國的比例和全世界比例可能為1%-2%。同時也取決于腸道基礎的情況，比如腸腔比較寬大，有便秘導致腸道蠕動異常；腸子比較長、彎比較多；做過一些腹部的手術，無論上腹部和下腹部，腸壁之間有粘連；既往有過不明原因的不全腸梗阻或者有過腸梗阻，是因為機械性的或者腸粘連導致，在做腸鏡的時候，穿孔的機會就會明顯增加。如果是正常做腸鏡，導致的腸穿孔的機會基本上在1%-2%，當然也取決于做腸鏡大夫的熟練程度。做腸鏡的大夫有一定的培養流程，以及獨立操作前的入門操作例數要求，在入門前，可以獨立操作之前，都有指導老師，在其監督下一起做腸鏡。