微浸潤癌和原位癌的主要區別在于是否突破了基底膜。
原位癌，也被稱為上皮內癌，通常僅累及上皮全層，即病變細胞在形態和生物學特性上與癌細胞相同。這些細胞尚未突破基底膜向下浸潤，這也是原位癌的一個關鍵特征。原位癌主要出現在鱗狀上皮或尿路上皮等被覆的部位，如子宮頸、食管、皮膚膀胱等處，有時也出現在發生鱗狀化生的黏膜表面，如鱗化的支氣管黏膜。因為原位癌沒有浸潤和轉移的能力，所以預后通常較好。
微浸潤癌則是指癌細胞突破了基底膜，向下浸潤。由于浸潤深度不大（小于5mm），因此通常被稱為微浸潤癌。微浸潤癌屬于早期癌，一般不會發生遠處轉移。
綜上所述，微浸潤癌和原位癌的主要區別在于病變細胞的浸潤深度。原位癌的細胞尚未突破基底膜，而微浸潤癌的細胞已經突破了基底膜向下浸潤，但浸潤深度較小。
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