肛門里面痛一陣一陣的隱痛可能是以下幾種原因導致：
1. 肛裂：典型的表現包括刀割樣或撕裂樣疼痛，通常在大便時或大便后出現，并伴有少量鮮紅色出血。
2. 肛周膿腫：表現為持續性腫痛或跳痛，肛門局部有腫大的膿包，觸摸可有波動感，皮溫較高。
3. 血栓性外痔：肛門出現脹痛或刺痛，伴有異物感。
4. 內痔嵌頓：以脹痛、灼痛為主，多由于痔靜脈曲張、血管破損、血栓形成，造成組織循環受限而脫出肛門外，無法回納，出現水腫、感染、壞死時，肛門局部疼痛劇烈。
5. 肛竇炎：一般表現為肛門部微痛、墜脹，排便時因大便壓迫發炎的肛竇可導致肛門部灼痛。
6. 肛管直腸腫瘤：早期無疼痛，后期因腫塊增大破潰，可出現肛門部墜脹、隱痛，常見有排便習慣改變、便血、腹脹、腹痛、消瘦等癥狀。
7. 功能性肛門直腸疼痛：表現為模糊鈍痛或痙攣性銳痛。
以上內容僅供參考，建議到正規醫院就診，明確診斷后在醫生的指導下從生活、藥物、手術等方面進行干預，盡快緩解不適。
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