羊水穿刺并不能100%排除畸形。
羊水穿刺是一種檢查方式，主要是檢查染色體異常，可以檢查出胎兒是否患有染色體疾病，只能夠檢查出部分的先天性畸形，如唐氏綜合征等。但是羊水穿刺并不能夠排除所有的畸形，如果是患有唇腭裂等畸形，羊水穿刺有可能會檢查不出來。所以羊水穿刺并不能完全排除畸形，還需要結合其他的檢查進行診斷。
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