早晨起床后腰疼但是活動后就好了，可能是以下原因導致的：

1. 腰部受涼：睡覺時腰部受涼（如吹空調或冬季受寒等），導致腰部肌肉僵硬板直，局部血液循環不暢，從而引起腰部疼痛。起床活動后，局部血液循環得到改善，疼痛癥狀得以緩解。
2. 腰肌勞損：由于睡覺時機體長時間處于一個姿勢，或者姿勢不正確，造成肌肉長時間處于張力狀態，導致肌肉勞損。起床活動后，肌肉勞損得到緩解，疼痛癥狀就減輕了。
3. 床墊不合適：床墊過軟或過硬，睡覺時無法維持脊柱的生理曲線，腰部肌肉得不到放松，從而導致腰疼。更換合適的床墊后，疼痛癥狀通常會得到緩解。
4. 腰椎小關節紊亂：腰部活動時，小關節的活動范圍較大，容易發生微小的錯位或水腫。起床活動后，小關節恢復正常位置，水腫減輕，疼痛癥狀就減輕了。
5. 腰部肌肉力量不足：腰部肌肉力量不足，無法支撐脊柱和上肢的重量，導致腰疼。通過適當的鍛煉和按摩等方法，可以增強腰部肌肉的力量，緩解疼痛癥狀。

如果以上方法不能緩解腰疼癥狀，建議及時就醫，排除其他潛在的疾病。平時要注意保持正確的睡覺姿勢和坐姿，避免長時間久坐和過度勞累。