膽汁反流性炎癥較重，或持續時間較長，則可能癌變。膽汁由肝臟合成，在膽囊儲存，通過膽道系統排泄到腸道，從而發揮正常生理功能。正常排泄之后，經十二指腸進入小腸，具有幫助消化含有脂肪的食物、幫助吸收脂溶性維生素，促進小腸蠕動等功能。 如果上述過程出現問題，則可出現反流，即膽汁未經過正常途徑到小腸，因各種原因導致的逆蠕動，或生理解剖結構改變之后，導致膽汁反流到胃或十二指腸，出現膽汁反流性胃炎，甚至是膽汁反流性食道炎，嚴重時可出現潰瘍和炎癥反應。如長期反流，因膽汁是堿性物質，會刺激黏膜發生炎癥，引起黏膜壞死，出現黏膜修復。在修復過程中如出現異型增生，慢慢可發展成癌，但可能性較小。所以，患者需要有癥狀及時就醫，以減少發生癌變的可能。