膽管反流可以出現惡心、發燒的情況，嚴重情況下可能引起膽管炎，尤其部分膽管下端開口較大時，吃的食物可以反流到膽管，經常出現持續低燒情況通常為反流性膽管炎的常見癥狀。此時需經常服用利膽藥物，促進膽汁排泄，同時飲食應保持規律，如果經常進食過量，更容易造成膽管反流。對于特別嚴重的情況，甚至還需要進行膽道的改道手術。膽管在正常情況下，通常不會發生反流，即膽管下端開頭的地方有Oddi括約肌，通常呈收縮狀態，食物或胃腸液不會反流到膽管。如果因部分疾病造成膽管下端開口不能正常收縮，不能阻止腸液往膽管反向的流動，會造成膽管的反流，即胃液、腸液反流進入膽管。現在隨做內鏡、ERCP，將膽總囊管下端切開進行治療，或者取石、放支架等，也可以造成膽管下端的開口功能受到影響，容易發生胃腸液反流到膽管的情況。