水飛薊賓膠囊的副作用一般比較輕微，主要會有些輕微的胃腸道反應，比如惡心、惡逆以及腹痛等。但一般副作用與用藥劑量、使用時間相關，用藥劑量越大、使用時間越長，可能上述癥狀越重，發生頻率越高。所以在用藥時，要根據具體情況具體來看，而且要考慮不同患者身體的耐受性也不一樣，也就是個體差異。所以在用藥時一定要在醫院經過醫生規范診療之后，明確有使用的適應癥，比如慢性肝炎、脂肪肝、肝功能異常等，再考慮使用這個藥。使用水飛薊賓膠囊要在醫生處方的指導下給予合適的劑量應用一段時間，保證用藥的安全、有效。但不排除個別患者用藥后可能出現不能耐受的反應或癥狀，這是不能排除的，這種情況遇到后，要及時咨詢藥師，或到醫院就診。至少在醫生指導下給予規范治療，以使癥狀得到及時的改善、緩解。為了了解這個藥，最好在用藥前詳細看說明書，在藥師指導下用藥。