多烯磷脂酰膽堿膠囊和水飛薊賓膠囊，如果是由于疾病治療的需要，可以在醫生的指導下聯合使用。由于兩個藥都是肝病的輔助治療用藥，多烯磷脂酰膽堿膠囊主要是用于輔助改善中毒性肝損傷以及脂肪肝、肝炎等，以及藥物、毒物、化學物質、酒精等引起的肝損傷，可以使用多烯磷脂酰膽堿膠囊物進行治療，起到輔助改善肝功能的作用。而水飛薊賓膠囊也是肝病的輔助治療用藥，用于治療急、慢性肝炎、脂肪肝，有助于肝功能異常的恢復。此外多烯磷脂酰膽堿膠囊的說明書中提到，該藥物需要隨餐服用，且要求用足夠量的液體整粒吞服，不可將膠囊嚼碎。而水飛薊賓膠囊在說明書中，沒有提到是在飯前還是飯后服用，說明在飯前飯后服用都可以，食物對于吸收和療效的發揮沒有顯著的影響。但在水飛薊賓膠囊的藥品說明書中提到，不良反應主要是胃腸道的癥狀，比如惡心、呃逆、胸悶等，因此一般也建議在餐后服用，可以最大限度的減少藥物對胃部的刺激。綜上所述，兩個藥如果是需要聯合使用時，都可以在隨餐的狀態下服用。