小肝癌的診斷方法主要是通過對肝癌高危人群定期的影像學篩查和腫瘤標記物篩查來確診，也有的患者是在無意當中體檢發現的肝臟占位，通過進一步檢查來確診。肝癌的高危人群包括慢性肝炎病毒感染、特別是乙肝和丙肝患者、長期飲酒、嚴重的脂肪肝患者，或者是食物、水被黃曲霉毒素所污染，經常接觸化學致癌物質以及有不明原因的肝硬化、肝癌家族史，對于此人群至少每半年要進行腹部超聲和甲胎蛋白的篩查，以早期發現肝癌的跡象。在體檢的時候發現肝臟占位，而普通超聲又沒有辦法來確診時，則需要通過腹部增強CT或腹部增強核磁，通過特異性的造影劑來確定肝臟占位的性質。典型的肝癌在增強CT或核磁上可以呈現為快進、快出的特點，對于診斷不清或者是高度可疑肝癌，而又沒有辦法確診的時候，還可以通過肝臟穿刺活檢來確認病灶的性質。