預防膽管結石的復發，最關鍵是手術避免損傷膽管。膽管一旦損傷，將來會有狹窄，必然產生結石。如果膽囊引起結石，患者需提前治療膽囊，不要等發生膽管結石、胰腺炎后再進行治療。胰腺炎有時也會引起膽管狹窄，容易出現結石，所以是預防為主。 將膽囊切除后很多醫生或者病人都有一個概念是吃的清淡、少油，實際上有弊端，少吃油則膽汁減少。膽汁少則容易在膽道系統的淤積，膽汁量不充沛。所以有時只要保持通暢，膽汁量充沛的情況下，膽管反而不容易生結石，所以有時鼓勵病人盡量吃好。 纖維十二指腸鏡進入以后盡量不切開乳頭，不切開下面肌肉的閥門，一旦損傷易導致結石。